| 民國99年(2010年) |
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4月
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2日，台灣聯合大學系統溫世仁卓越學術講座邀請DNA之父－Dr. James D. Watson蒞校演講：From Discovery of Double Helix Structure of DNA to Developing a Research Career。
14日，經99年度傑出校友遴選委員會遴選出本校第7屆學術類傑出校友為吳肇卿校友及宋青華校友。
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5月
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根據QS （英國高等教育調查公司）公布2010亞洲最佳200所大學排名，本校居第41名。
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6月
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28日，台灣聯合大學系統溫世仁卓越學術講座邀請Prof. Ahmed Hassan Zewail演講：The Nanoworld in 4D. 。
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7月
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14日，本校頒授王正中院士「榮譽理學博士學位」。
30日，吳妍華代理校長任期屆滿，梁賡義校長接任本校第6任校長，新、卸任校長於教育部大禮堂舉行國立大學校長及所屬館所首長聯合交接典禮。
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8月
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護理學系暨研究所更名為「護理學系」（含學士班、博士班、碩士在職專班）。
增設國際衛生碩士學位學程。
增設分子醫學博士學位學程。
2日，本校假活動中心表演廳舉行梁賡義校長就職典禮。
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9月
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根據QS （英國高等教育調查公司）公布之2010年世界大學排名，本校居第290名。
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10月
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2008年諾貝爾生理醫學獎得主Prof. Francoise Barré-Sinoussi應台灣聯合大學系統之邀，擔任溫世仁卓越學術講座，於10月4日蒞臨本校進行首場演講，講題為：HIV, a discovery highlighting the global benefit of translational research.。
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| 民國98年(2009年) |
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2月
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21日，本校與財團法人振興復健醫學中心簽訂合作辦法。
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3月
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24日，經98年度傑出校友遴選委員會遴選出本校第6屆學術類傑出校友為黃自強校友及陳宜民校友。
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7月
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7日，本校與馬偕醫學院締結策略聯盟。
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8月
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生物醫學工程學系學士班開始招生。
生醫光電工程研究所更名為「生醫光電研究所」。
物理治療暨輔助科技學系碩士在職專班停招。
24日，原國立中國醫藥研究所管理之國有建物，奉行政院核准撥由本校使用。 |
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9月
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30日，本校頒授曾志朗院士「榮譽理學博士學位」。 |
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10月
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4日，本校「校長遴選委員會」投票選出梁賡義院士為本校第6任校長。
15日，本校頒授錢煦院士「榮譽工學博士學位」。
20日，本校邀請胡流源院士擔任98年度校長講座，講題為：Bioengineering - The Bridge between Biology and Orthopaedic Surgery.
23日，本校與馬偕紀念醫院簽署學術合作協議書。
英國《時報高等教育增刊》( The Times Higher Education Supplement )世界大學排名公佈，陽明大學為第306名，並位居國內各大學第4名。
上海交通大學公佈世界大學學術排名，陽明大學位居第450名。 |
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11月
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9日，奉教育部函同意，本校校長職務自98年11月12日起至99年8月1日新任梁賡義校長到任前，由吳妍華教授代理。 |
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12月
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11日，高等教育評鑑中心公佈98年度上半年大學校院系所評鑑結果，本校50個受評班制數中，有48個班制獲認可「通過」，2個班制列為「待觀察」。 |
| 民國97年(2008年) |
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1月
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1日，本校附設醫院在宜蘭院區舉行揭牌慶典。當日貴賓雲集，共同開啟陽明大學於蘭陽醫療服務的新紀元。 |
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2月
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20日，本校藝文中心正式揭幕並舉辦首展。
27日，本校頒授中央研究院何大一院士「榮譽理學博士學位」。 |
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5月
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1日，財團法人高等教育評鑑中心公佈2008年台灣基礎科學指標 (Essential Science Indicators, ESI)論文統計結果，本校教師平均論文數居台灣各大學之冠。 |
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6月
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經97年度傑出校友遴選委員會遴選出本校第五屆服務類傑出校友為陳厚全醫師。 |
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8月
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科技與社會研究所碩士班開始招生。
心智哲學研究所碩士班開始招生。
腦科學研究所博士班開始招生。
臨床醫學研究所、熱帶醫學研究所整併為臨床醫學研究所（碩士班、碩士在職專班、博士班）。
28日，2008世界大學科研論文質量評比公布，本校在不分領域排名為第475名。在分領域排名方面，本校以臨床醫學領域排名世界第264名，台灣第2名；神經科學與行為學領域則為台灣第1名。
28-30日，「中藥全球化聯盟」（Consortium for Globalization of Chinese Medicine, CGCM）於本校大禮堂舉行第7屆研討會，馬英九總統蒞臨開幕典禮致詞。
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9月
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17日，德國University of Heidelberg校長Dr. Bernhard EITEL一行蒞訪本校，並與吳校長共同簽署姐妹校之備忘錄。 |
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10月
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14日，英國《時報高等教育增刊》( The Times Higher Education Supplement )世界大學排名(THE-QS World University Rankings)公布2008年世界大學排行，陽明大學排名341，居台灣各大學第3名。另外在台灣高等教育評鑑中心2008年世界大學科研論文評比，本校亦首度晉級世界前500大。
23-25日，第20屆亞太地區生物化學及分子生物學聯合年會（20TH FAOBMB Taipei Conference）於本校會議中心舉行，會議主題為「生命科學中未知的領域」。開幕儀式邀請蕭萬長副總統蒞臨致詞。
26日，陽明大學校友總會於本校醫學館舉辦成立大會。
26-28日，首次在亞洲舉辦的「全球女性科學家會議」於本校舉行，開幕儀式邀請馬英九總統蒞臨致詞。 |
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